重庆大学电子显微镜中心是由材料学院引进的几位电镜专家倡导并整合人才引进经费、课题经费和学校直接投入经费建设，于2015年11月正式揭牌。电镜中心共计投入1.2亿元，拥有大型电子分析表征类设备近20台，以及完备的样品制备设施设备，包括目前世界上最先进的FEI TitanChemiSTEM球差校正电镜、三维原子探针等尖端设备，还自主研发了世界首台三维取向透射电镜和像差纠正超快自旋低能电子显微镜等。电镜中心拥有已长江学者为学术带头人，海外归国博士为骨干的高水平电子显微分析人才队伍。中心以高分辨、三维、超快动态和原创技术为发展战略，以高端人才依据其从事的前沿研究购置和开发所需的尖端设备，这些尖端设备反过来又吸引更多的高端人才来中心工作，高端人才和尖端设备共同促进前沿研究的开展与重大科研成果的诞生。电镜中心注重国际合作与交流，在三维取向透射电镜和像差纠正超快自旋低能电子显微镜的开发过程中，以“全球开发，全球共享”的模式，汇集国际上相关领域最顶尖的科学家共同开发新的大型科学装置，并计划在开发成功后成为国际开放平台，共同解决科学界在相关领域面临的重大问题。